O Departamento RIO também tem forte inserção nosprogramas de pós-graduaçãostrictu sensudaUSPe daFMRP. São três programas acadêmicos de mestrado e doutorado e dois programas de mestrado profissional.
A pesquisa científica na área médica é forte no Departamento RIO. Seus docentes e pesquisadores desenvolvem desde pesquisa básica no laboratório com uso de células, experimentação animal, passando pelapesquisa clínica e ensaios clínicosaté modelos computacionais e de inteligência artificial. Um exemplo é oCentro de Terapia Celular, um dos Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPID) apoiados pela FAPESP. Os docentes também participam de redes de cooperação nacional e internacional, como para melhorar o tratamento precoce de pacientes comacidente vascular cerebral, com impacto significativo na qualidade de atenção à saúde do brasileiro.